Abstract :Organizmalar birbirinden genetik yapılarını oluşturan protein yapılarındaki amino asit dizilişleri ve bu amino asitlerin eşamlamlı kodonların frekans bilgileri ile ayrıştırmak mümkündür. Dolaysıyla organizmaların DNA dizilerini kodlarken amino asit dizileri yerine farklı kodon kullanım sıklıklarını tür tespitinde kullanmak mümkün olabilir. Kodon frekans bilgileri ile organizmaları DNA üzerinden ayrıştırmak uygun ve hızlı bir yaklaşımdır. Organizmaların taksonomik kimliğini belirlemede sıkça kullanılan araçlardır. Bu çalışmada kümeleme yöntemlerini (DBSCAN, OPTICS, MEAN-SHIFT, BIRCH, AGLOMERATIF ve K-MEANS) kullanarak kodon frekanslarına dayalı olarak hem alemleri (viral, fajal, bakteriyel, arkeal ve ökaryotik) hem de DNA-tür (nükleer, mitokondriyal ve kloroplast) için kümeleme işlemi gerçekleştirilmiştir. Bu amaçla CUTG (Codon Usage Tabulated from Genbank) veri seti kullanılmıştır. Elde edilen sonuçlara göre öğreticisiz öğrenme yöntemlerinden olan kümeleme yöntemlerinin sınıf/küme bilgisi olmadan kodon frekanslarına dayalı organizmaları ayırmada başarılı sonuçlar verdiği görülmüştür. Keywords : Genetik, Kodon, Makine Öğrenmesi, Kümeleme
