Expression profi les of PIK3CA, RUNX3, COX-2 and DMBT1 genes in brain tumor prognosis: a preliminary study

Authors : Sunde YILMAZ, Çığır Biray AVCI, Z. Özlem Doğan ŞIĞVA, Yavuz DODURGA, Nezih OKTAR, Sinem NUMANOĞLU, Tayfun DALBASTI, Taner AKALIN, Cumhur GÜNDÜZ

Pages : 109-114

View : 19 | Download : 5

Publication Date : 2010-10-01

Article Type : Research Paper

Abstract :Beyin tümörleri de dahil olmak üzere kanser gelişiminde önemli rol oynayan genlerin iki ana alt grubu onkogenler ve tümör baskılayıcı genlerdir. Bu ön çalışmanın amacı, tümör baskılayıcı genlerden RUNX3 insert ignore into journalissuearticles values(Runt-relatedtranscription factor 3);, DMBT1 insert ignore into journalissuearticles values(Deleted in Malignant Brain Tumors 1); ve onkogenlerden PIK3CA insert ignore into journalissuearticles values(Fosfoinosid- 3-kinaz, katalitik, alfa polipeptid);, COX–2 insert ignore into journalissuearticles values(Siklooksigenaz-2); genlerinin beyin tümörlerinde ifade düzeyinisaptamaktır. On dört olgunun beyin tümörü dokularından hücre kültürü ortamında çoğalması sağlandı. Kültüre edilmiş hücrelerden total RNA’lar izole edildi. Gerçek zamanlı RT-PCR metodu kullanılarak onkogen ve tümör baskılayıcı genlerin ekspresyon profi llerinin bağıl oranları saptandı. U87MG hücre hattı pozitif kontrol olarak kullanıldı. DMBT1, RUNX3, COX-2 ve PIK3CA genlerinin bağıl oranları ortalaması sırasıyla 72.2, 59.3, 0.119ve 48.5 bulundu. COX-2 aşırı ekspresyonu, anlamlı olarak azalmış sağkalım ile korelasyon gösterdi insert ignore into journalissuearticles values(Log-Rank,p= 0.049);. DMBT1 ve RUNX3 genlerinin baskılanması azalmış sağkalımla ilişkili olduğu saptandı ancak PIK3CA, DMBT1 ve RUNX3 ekspresyonları arasında ve sağkalım üzerinde anlamlı bir farklılık saptanmadı. Yüksek COX-2 ekspresyonu klinik olarak fazla agresif beyin tümörleri ile ilişkili olduğu gösterildi. Elde ettiğimiz ön deney sonuçlarımız, COX-2 geninin terapötik hedef olarak kullanılabilir olabileceğini önermektedir.
Keywords : Beyin tümörü, gen ekspresyonu, U 87MG