Covariate Adjusted ROC Curve Analysis and An Application

Authors : Ünal ERKORKMAZ, Ertuğrul ÇOLAK, Cengiz BAL, Kazım ÖZDAMAR, İlker ETİKAN, Hasan EKERBİÇER

Pages : 140-149

View : 18 | Download : 9

Publication Date : 2015-12-11

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Bu araştırmada, benzetim çalışmalarından yararlanarak düzeltilmiş ROC eğrisi altında kalan alanın belirli koşullardaki değişiminin iki değişkenli normal dağılım modeli ile incelenmesi ve bu algoritmanın gerçek verilerle uygulanması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntemler: Benzetimde kullanılacak veri seti farklı koşullar altında türetilmiştir. Gerçek uygulama verisi olarak Gaziosmanpaşa Üniversitesi Tıp Fakültesi Üroloji Anabilim Dalında 2005-2007 yılları arasında prostat kanseri ön tanısı için prostat biyopsisi yapılan 125 hastanın PSA değerleri ile yaşları kullanılmıştır. Algoritma ve kodlar farklı koşullardaki benzetim modellerine göre SAS istatistik yazılımında PROC IML prosedürü kullanılarak yazılmıştır. Bulgular: Benzetim çalışmasına göre, biomarker göstergeleri sağlam grupta sabit ve hasta grupta sağlam gruba göre daha düşük veya eşit ise hem AUC insert ignore into journalissuearticles values(ROC Eğrisi Altında Kalan Alan); hem de düzeltilmiş AUC’nin düşük değerler aldığı bulunmuş ancak aralarında önemli fark görülmemiştir. Hasta grupta daha yüksek biomarker göstergeleri olduğunda ROC eğrisi altında kalan alan belirgin şekilde yüksek bulunmuştur. Ayrıca biomarker ile ortak değişken arasındaki korelasyon hasta grupta yüksek ve AUC yaklaşık 0.75 ise düzeltilmiş AUC ile AUC arasındaki fark önemli bulunmuştur. Prostat Kanseri biomarker’ı olan PSA’yı yaşa göre düzeltilmiş olarak incelediğimizde, düzeltilmiş AUC değerinin düzeltilmemiş AUC değerine göre daha yüksek olduğu bulunmuştur. Sonuç: Düzeltilmiş ROC modelinin uygulanabilir olması için ortak değişken ile biomarker, dağılımlarının çift iki değişkenli normal dağılım göstermesi gerekmektedir. Biomarker, hasta ve sağlam ayrımını iyi yapıyorsa ek bir değişkene ihtiyaç duyulmamaktadır. Sağlam gruptaki korelasyon 0’a yaklaştıkça ve hasta gruptaki korelasyon 0.50 ise ve AUC 0.75 ve daha küçük ise ortak değişkenin modele katılması gerekir. Hasta ve sağlam gruplarda örnek büyüklüğü 50’den küçük olması durumunda model etkili biçimde çalışmamaktadır. 
Keywords : Düzeltilmiş ROC, AUC, Ortak Değişken, PSA, Benzetim