Training ANFIS structure using genetic algorithm for liver cancer classification based on microarray gene expression data

Authors : Bülent Haznedar, Mustafa Turan Arslan, Adem Kalınlı

Pages : 54-62

Doi:10.16984/saufenbilder.283823

View : 14 | Download : 4

Publication Date : 2017-02-01

Article Type : Research Paper

Abstract :  Sınıflandırma, verilerin analiz edilmesi için önemli bir veri madenciliği tekniği olup tıp, genetik ve biyomedikal mühendisliği başta olmak üzere birçok alanda kullanılmaktadır. Özelikle tıp alanında DNA mikroarray gen ekspresyon verilerini sınıflandırmaya yönelik yapılan çalışmalarda artış görülmektedir. Ancak, mikroarray gen ekspresyon insert ignore into journalissuearticles values(ifade); verilerinde bulunan gen sayılarının çokluğu ve bu veriler arasında çoğunlukla doğrusal olmayan ilişkiler bulunması gibi nedenlerden dolayı geleneksel sınıflandırma algoritmalarının başarımları sınırlı kalabilmektedir. Bu sebeplerden dolayı son yıllarda sınıflandırma probleminin çözümü için yapay zekâ tekniklerine dayalı sınıflandırma yöntemlerine olan ilgi giderek artmaya başlamıştır. Bu çalışmada, karaciğer mikroarray kanser veri setinin sınıflandırılması için Adaptif Ağ Tabanlı Bulanık Mantık Çıkarım Sistemi insert ignore into journalissuearticles values(ANFIS); ve Genetik Algoritmaya insert ignore into journalissuearticles values(GA); dayalı hibrid bir yaklaşım önerilmiştir. Simülasyon sonuçları, diğer bazı yöntemlere ait sonuçlarla karşılaştırılmıştır. Elde edilen sonuçlardan, önerilen yöntemin diğer yöntemlere göre daha başarılı olduğu görülmüştür.
Keywords : Neuro fuzzy, ANFIS, genetik algoritma, sınıflandırma, mikroarray gen ifade