Doğal Streptococcus thermophilus İzolatlarında comX Gen Varlığına Bağlı DNA Transfer Frekansının Belirlenmesi

Authors : Ferit Can YAZDIÇ, Altuğ KARAMAN, İsmail AKYOL, Mehmet Sait EKİNCİ, Emin ÖZKÖSE

Pages : 9-23

View : 16 | Download : 6

Publication Date : 2018-04-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Alternatif sigma faktör olan comX, streptokoklarda dışarıdan DNA alabilme kapasitesini belirleyen  genlerin transkripsiyonunu kontrol eden ve dolaysıyla bu suşların yabancı genetik materyali kabul etme frekansı  ile ilişkili olan bir gendir. Bu nedenle doğal izolatlardaki varlığının tespit edilmesi, bu izolatların konjugasyon  kapasitelerinin belirlenmesi açısından önem arz etmektedir. Bu çalışmada 106 farklı Streptococcus thermophilus  izolatında comX geninin varlığı araştırılmıştır. Bu izolatların 46 tanesinde polimeraz zincir tepkimesi insert ignore into journalissuearticles values(PZT);  yöntemi ile comX gen varlığı tespit edilmiş ve nükleotid dizileri belirlenmiştir. Kompetent hücrelerin  konjugasyon frekansları için pNZ276 plazmiti ve katalaz testi kullanılmıştır. BioSt-7, 16, 19, 23, 24, 25, 29, 30,  36, 37, 42 ve 46 nolu izolatların konjugasyon özellikleri tespit edilmiştir. BioSt-19, 24, 25,29 ve 42 nolu  izolatların da konjugasyon frekansları % 40’tan yüksek bulunmuş ve konjugasyon oranı ile comX gen dizisi  arasında ilişki tespit edilmiştir. ComX proteininde 72. amino asit pozisyonundaki asparajinin yerine izolösin  değişimi insert ignore into journalissuearticles values(N→I);, konjugasyon frekansını artırmıştır. Bu çalışmanın sonuçları, comX gen dizisi üzerindeki  değişim mutasyonlarının izolatların gen transfer sıklığını önemli derecede etkileyebileceğini, suşlara göre  farklılık içereceğini ve konjugasyon özelliğini değiştirebileceğini göstermiştir.
Keywords : Streptococcus thermophilus, comX geni, konjugasyon frekansı