Application of Taqman RTi-PCR Assay in Specific Detection of Klebsiella pneumoniae from Surface Waters

Authors : Esen TUTAR, Kübra Sueda AKINCI, İsmail AKYOL

Pages : 95-106

View : 17 | Download : 5

Publication Date : 2018-04-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Klebsiella pneumoniae , nozokomiyal enfeksiyonlara neden olan fırsatçı bir patojendir. Klebsiella pneumoniae `nin normal habitatı insan bağırsaklarıdır ve bakteri normal florasında hiçbir enfeksiyona neden olmaz. Çoğu Klebsiella enfeksiyonu hastane kaynaklıdır ancak K. pneumoniae doğada yaygın olarak bulunmasından dolayı çevresel kaynaklardan da transfer edilebilir. Ayrıca, K. pneumoniae `nin çevresel izolatları, klinik izolatlar gibi insanlar için bir risk oluşturmaktadır. Bu çalışma ile PCR ve RTi-PCR analizlerini kullanarak yüzey sularında K. pneumoniae `nin potansiyelini araştırmak amaçlanmıştır. Klebsiella pneumoniae için yüksek hassasiyet ve özgüllük ile PCR ve RTi-PCR analizleri optimize edilmiştir. Yüzey suları örnekleri farklı bölgelerden toplanmış ve PCR ve RTi-PCR deneyleri kullanılarak analiz edilmiştir. Sonuçlar, test edilen su örneklerinin K. pneumoniae ile farklı seviyelerde kontamine olduğunu göstermiştir. RTi-PCR bulguları geleneksel PCR ile teyit edilmiştir.
Keywords : K pneumoniae, Taqman assay, RTi PCR, Yüzey suları