Yozgat ve Kırşehir İllerinde Tüketime Sunulmuş Patates Yumrularında Bakteriyel Yumuşak Çürüklük Hastalığı Etmeni Pectobacterium İzolatlarının İzolasyonu ve Tanılanması

Authors : Murat OZTURK, Soner SOYLU

Pages : 332-342

Doi:10.33462/jotaf.974350

View : 24 | Download : 7

Publication Date : 2022-05-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Pectobacterium spp. geniş bir konukçu yelpazesine sahip, her ortamda bulunan bakteriyel bitki patojenlerden biri olup, istila ettiği bitki dokusunda Bakteriyel Yumuşak Çürüklük olarak bilinen hastalığa neden olur. Bu çalışmada 2018-2019 yılları arasında Yozgat Merkez ve Kırşehir Kaman ilçesindeki yerel pazar, manav ve zincir marketlerde satışa sunulan patates yumrularında bakteriyel yumuşak çürüklük hastalığına neden olan Pectobacterium spp. izolasyonu, biyokimyasal, patojenisite ve moleküler yöntemlerle tanılanması amaçlanmıştır. Survey yapılan market ve manavlardan 168 yumru örneği toplanmıştır. Tipik yumuşak çürüklük belirtisi gösteren ve göstermeyen şüpheli yumrularda pektolitik izolatların varlığının araştırılması amacıyla nemli hücre testi yapılmıştır. Çürüme belirtileri gösteren 54 farklı yumru kesitlerinden pektolitik izolatların izolasyonu Kristal Violet Pektat insert ignore into journalissuearticles values(CVP); besiyeri üzerinde yapılmıştır. CVP besi yerinde çukur oluşturan pektolitik koloniler NA besi yerine saflaştırılması ile toplam 42 adet bakteri izolatı elde edilmiştir. Elde edilenler bakteri izolatları arasında 27 farklı izolatın Nutrient Agar insert ignore into journalissuearticles values(NA); besi yerinde şeffaf, parlak, düzensiz, krater formda koloni oluşturduğu belirlenmiştir İzolatların tamamı gram ve oksidaz negatif, katalaz pozitif, fakültatif anaerob, floresen olmayan koloni morfolojisine sahip özelliklerde sergilemiş ve patates dilimi üzerinde yumuşak çürüklüğe neden olmuştur. Elde edilen izolatlar ile yapılan PCR çalışmasında, 54 simptomlu yumru örneğinin 19 adedinde P. carotovorum subsp. carotovorum insert ignore into journalissuearticles values(9 izolat);, P. atrosepticum insert ignore into journalissuearticles values(6 izolat); ve Pectobacterium spp. insert ignore into journalissuearticles values(4 izolat); enfeksiyona neden olan etmenler olarak tanılanmıştır. Tipik hastalık belirtisi göstermeyen 114 yumru örneğinin 8 adedinde P. carotovorum subsp. carotovorum insert ignore into journalissuearticles values(5 izolat);, P. atrosepticum insert ignore into journalissuearticles values(2 izolat); ve P. carotovorum subsp. brasiliense insert ignore into journalissuearticles values(1 izolat); etmenleri latent enfeksiyon sorumlusu olarak belirlenmiştir. Bu çalışma ile tüketime yönelik olarak satışa sunulmuş patates yumrularında Pectobacterium izolatlarının varlığı belirlenerek patojenin farklı bölgelere transfer edilebileceği belirlenmiştir. Tüketim için satışa sunulan patates yumrularının hastalıktan ari bölgelere Pectobacterium izolatlarının nakledilmesinde önemli bir inokulum kaynağı olduğu düşünülmektedir.
Keywords : Pectobacterium spp, Yumuşak Çürüklük, Latent Enfekteli Yumru, Patates, PCR