SOĞAN ÜRETİMİ İLE İLİŞKİLİ FARKLI FUSARİUM TÜRLERİNİN PCR-RFLP ANALİZİ

Authors : Harun BAYRAKTAR, Kübra TEKİN, Göksel ÖZER

Pages : 194-198

Doi:10.7161/anajas.2014.29.3.194-198

View : 13 | Download : 6

Publication Date : 2014-07-25

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışma kapsamında ülkemizde soğan üretimi ile ilişkili farklı Fusarium türleri arasındaki genetik akrabalık PCR-RFLP yöntemi ile araştırılmıştır. F. oxysporum, F. solani, F. acuminatum, F. equiseti, F. proliferatum, F. redolens ve F. culmorum’ u temsil eden 42 fungus izolatının ribozomal DNA ITS bölgesi ITS1/4 primerleri ile çoğaltıldıktan sonra HinfI, AluI, MspI, EcoRI restriksiyon enzimleri ile kesilmiştir. PCR analizi sonucunda tüm izolatlardan 550-570 bp büyüklüğünde tek bir DNA fragmenti çoğaltılmıştır. Enzim kesimleri ise Fusarium türlerinin birbirinden ayrılmasını sağlayan 17 farklı enzim profili oluşturmuştur. ITS bölgesinin RFLP analizi ile oluşturulan dendogramda tüm Fusarium türleri farklı gruplar içerisinde yer almıştır. Fusarium türleri arasındaki benzerlik oranının ise 0.70-0.13 arasında değiştiği tespit edilmiştir. Elde edilen sonuçlar enzim profillerinin soğan üretim alanlarında ekonomik olarak önemli kayıplara yol açan Fusarium türlerinin ayrılmasında oldukça faydalı olduğunu göstermiştir.
Keywords : Soğan, Fusarium spp, ITS, PCR RFLP