Genetic Diversity Analysis of Aydın/Turkey Dittrichia viscosa (L). Greuter ( Asteraceae) Populations Using of RAPD Markers

Authors : Emre SEVİNDİK, Sefa UZUN, Mehmet Yavuz PAKSOY

Pages : 148-152

View : 16 | Download : 7

Publication Date : 2019-04-22

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmada, Türkiye`nin Aydın bölgesinde yayılış gösteren Dittrichia viscosa popülasyonlarının RAPD markırları kullanılarak genetik çeşitliliği gerçekleştirilmiştir. Dittrichia viscosa örneklerinin yapraklarından genomik DNA izolasyonu ticari kit kullanılarak gerçekleştirildi. Sekiz adet RAPD primeri popülasyonlar arasındaki genetik çeşitliliği belirlemek için kullanılmıştır Polimeraz Zincir Reaksiyonu,  DNA örnekleri ve primerler kullanılarak gerçekleştirildi. PCR ürünleri agaroz jel elektroforezinde yürütülüp, UV ışığı altında görüntülendi. Tüm jel görüntüleri incelenmiş olup polimorfik bantların varlığı ve yokluğu 0 ve 1 olarak skorlandı. Primerlerden toplam 50 karakter elde edildi. Popülasyonlar arasındaki filogenetik ağaç ve genetik uzaklıklar PAUP 0 4.0b10 analiz programı kullanılarak hesaplandı. PAUP analizine göre, en yakın genetik mesafe 0.20000 değer ile Merkez ve İncirliova popülasyonları arasında iken, en uzak genetik mesafe 0.64000 değer ile Koçarlı ve Çakmar, İncirliova ve Koçarlı popülasyonları arasında çıkmıştır. Filogenetik ağaç UPGMA algoritması kullanılarak elde edilmiş olup, ağaç iki kladdan oluşmuştur. Sonuçlar, RAPD markırlarının Dittrichia viscosa popülasyonları arasındaki genetik ilişkileri göstermek için yararlı araçlar olduğunu öne sürmektedir.
Keywords : Dittrichia viscosa, RAPD, genetik çeşitlilik, Türkiye