Success of DNA extraction and PCR amplification from dry pinned sand bees (Andrena spp. Fabricius, 1775) using newly-designed primers

Authors : Canan HAZIR, Clive H. BOCK

Pages : 79-96

Doi:10.16970/entoted.460948

View : 14 | Download : 6

Publication Date : 2019-03-01

Article Type : Research Paper

Abstract :İğnelenerek kurutulmuş kum arısı müze örneklerinin insert ignore into journalissuearticles values( Andrena spp.  Fabricius, 1775); insert ignore into journalissuearticles values(Hymenoptera: Andrenidae); DNA ekstraksiyonu için uygunluğu incelenmiş ve gelecekteki çalışmalarda DNA analizi amacıyla yeni primerlerin etkinliği değerlendirilmiştir. Otuz yedi altcins ve 101 türü temsil eden 222 iğnelenmiş kuru arı örneği ve etanol içerisinde saklanmış 21 türe ait 34 arı örneği olmak üzere toplamda 256 örnek analiz edilmiştir. DNA ekstraksiyonu için birkaç farklı protokol denenmiş ve örneklerin tamamından DNA izole edilmiştir. En yüksek kaliteli DNA etanol içerisinde saklanan örneklerden elde edilmiştir. DNA amplifikasyonunda test edilen 31 primerden 14 tanesi ya yeni ya da yeniden tasarlanmıştır. Primerlerin sekans uzunluğu 130 ile 1571 bp arasında değişkenlik göstermiştir. Yirmi beş türe ait 32 örneğin üç-dört DNA lokusu başarılı bir şekilde çoğaltılmıştır. Bu çalışma, gelecekte DNA elde edilme ihtimali olan arı örneklerinin saklama koşullarının ve uygun primer seçiminin önemini ortaya koymuştur. Bazı primerler uygun gen bölgelerinin kullanılması şartıyla tür teşhislerini yapmaya yarayacak bilgileri sağlayabilirler.
Keywords : Andrena, DNA, moleküler, müze örnekleri, kum arıları