Identification, distribution and genetic diversity of Globodera rostochiensis (Wollenweber, 1923) Skarbilovich, 1959 (Tylenchida: Heteroderidae) populations in Turkey

Authors : Ahmet ALTAŞ, Emre EVLİCE, Göksel ÖZER, Abdelfattah DABABAT, Mustafa İMREN

Pages : 385-397

Doi:10.16970/entoted.740223

View : 14 | Download : 6

Publication Date : 2020-09-01

Article Type : Research Paper

Abstract :Altın nematod, Globodera rostochiensis insert ignore into journalissuearticles values(Wollenweber, 1923); Skarbilovich, 1959 insert ignore into journalissuearticles values(Tylenchida: Heteroderidae); dünyada ekonomik açıdan en önemli patates zararlılarından birisidir. Genellikle patates yetiştirilen alanlarındaki dağılımları ve yoğunluklarını belirlemek amacıyla bu nematod için rutin olarak testler gerçekleştirilmektedir. Morfolojik ve moleküler analizler bu nematodun kesin tanısını yapmak ve mücadele stratejilerini oluşturmak amacıyla kullanılmaktadır. Bu çalışma, İzmir İli’nin Bozdağ ve Ödemiş ilçelerinden 2017 ve 2018 yılları patates yetiştiriciliği sezonlarında alınan toprak örneklerinin %96`sının G. rostochiensis ile enfekte olduğunu göstermiştir. Bulaşık alanlardaki ortalama kist sayısı, 0.01 ila 3.70 kist g-1 toprak arasında değişmiştir. Globodera rostochiensis `in ikinci dönem larva ve kistlerinin morfolojik ve morfometrik karakterlerinin incelenmesi, Bozdağ ve Ödemiş’ten elde edilen popülasyonlarda arasındaki hafif farklılıkları ortaya koymuştur. Tanımlamanın doğruluğunu değerlendirmek için, tüm popülasyonlar için kısmi ribozomal DNA sekansları amplifiye edilmiş, sekanslanmış ve GenBank veritabanına kaydedilmiştir. Morfolojik ölçümler ve filogenetik analizler sonucunda Bozdağ ve Ödemiş`ten elde edilen popülasyonlar arasında küçük farklılıkların olduğu belirlenmiştir. Sekansların GenBank`ta mevcut karşılık gelen G. rostochiensis popülasyonlarıyla karşılaştırılması sonucunda nükleotid benzerliği %99.89-100 oranında görülmüştür. Bu çalışmanın sonuçları, bu zararlıyı daha etkili bir şekilde karantinaya almak için nematodun fizyolojisini, ekolojisini ve biyolojisini daha iyi anlamaya yardımcı olacaktır.
Keywords : Globodera rostochiensis, ITS, İzmir, morfoloji, filogenetik