Türkiye Anadolu Eşeği (Equus asinus)’nin Mitogenom Karakterizasyonu ve Filogenetik İlişkileri

Authors : Osman İBİŞ

Pages : 257-267

Doi:10.19159/tutad.569435

View : 14 | Download : 6

Publication Date : 2019-10-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmanın amacı, Türkiye Anadolu eşeği insert ignore into journalissuearticles values( Equus asinus );’nin ilk mitogenom karakterizasyonunu yapmak ve filogenetik ilişkilerinin ortaya çıkarılmasına katkı sağlamaktır. Anadolu eşeğine ait bir örneğin komple mitokondriyal genomu, Long-Range PCR ve Yeni Nesil Dizileme tekniği ile karakterize edilmiş ve Bayesian, Maksimum Likelihood ve Neighbor-Joining metotlarıyla filogenetik analizler yapılmıştır. Komple mitogenom, 13 protein kodlayan gen, 22 taşıyıcı RNA, 2 ribozomal RNA ve bir kodlama yapmayan kontrol bölgesi insert ignore into journalissuearticles values(D-loop); içeren, 16.551 baz çifti uzunluğunda tipik dairesel DNA moleküldür. Mitogenomun ortalama nükleotid kompozisyonu, memeli mitogenomları aralığında olup; adenin için % 32.32, timin için % 25.78, sitozin için % 28.67, guanin için % 13.23’tür; a denin+timin içeriği insert ignore into journalissuearticles values( % 58.10 );, guanin+sitozin içeriğinden insert ignore into journalissuearticles values( % 41.90 ); daha fazladır. Toplam 14 taşıyıcı RNA, 12 protein kodlayan ve 2 ribozomal RNA geni ağır zincir üzerinde kodlanmakta, 8 taşıyıcı RNA ve bir protein kodlayan gen insert ignore into journalissuearticles values(ND6); ise hafif zincir üzerinde kodlanmaktadır. Gen yapısı, organizasyonu ve kompozisyonu diğer atgillere benzerdir. Filogenetik analizler, Türkiye Anadolu eşeğinin, Çin evcil eşeklerine Avrupa evcil eşeklerinden daha yakın olduğunu ve Afrika yabani eşeklerinden insert ignore into journalissuearticles values(Somali yabani eşeği gibi); köken almış olabileceğini göstermiştir. Bu çalışma, Türkiye eşekleri ve diğer atgilleri içeren gelecekteki moleküler çalışmalar için Anadolu eşeğinin referans mitogenom verisini sunmuştur.
Keywords : Equus asinus, Yeni Nesil Dizileme, mtDNA, mtDNA, filogeni