Karabuğday (Fagopyrum esculentum Moench) Bitkisinden Hazırlanan Silaj Örneklerinin Kalitesi Üzerine Etkili Olan Laktik Asit Bakteri Profilinin DNA Parmak İzi Tekniği ile Tanımlanması

Authors : Çiğdem YAMANER, Mehtap ALKAN, Ebru ARSLAN HALAVURT, Taha Harun TEKİN

Pages : 1-11

Doi:10.19159/tutad.742929

View : 16 | Download : 14

Publication Date : 2021-02-28

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmada, Türkiye’nin Ege Bölgesi’nde yer alan Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Ziraat Fakültesi deneme alanında yetiştirilen karabuğday insert ignore into journalissuearticles values(Fagopyrum esculentum Moench);’dan hazırlanan silaj örneklerindeki laktik asit bakteri insert ignore into journalissuearticles values(LAB); profillerinin M13 ve insert ignore into journalissuearticles values(GTG);5 tekrarlı dizi primerleri ile PCR-DNA-parmak izi tekniği kullanılarak belirlenmesi ve baskın suşlar hakkında veri elde edilmesi hedeflenmiştir. Çalışmada, farklı kuru madde insert ignore into journalissuearticles values(KM); içeriklerine sahip karabuğday örneklerine 2 farklı konsantrasyonda insert ignore into journalissuearticles values(1.5x105-1.5x106 kob g-1); inokulant ve 2 farklı konsantrasyonda insert ignore into journalissuearticles values(4-6 L t-1); formik asit ilave edilerek hazırlanan 15 farklı silaj örneği kullanılmıştır. İlk olarak 15 farklı silaj örneğinin KM, pH ve Fleig puanları, daha sonra bu örneklerin toplam LAB sayıları ve LAB’ların cins düzeyinde çeşitliliği belirlenmiştir. Silaj örneklerinden laktik asit bakterileri olduğu tespit edilen 50 izolat elde edilmiş ve LAB çeşitliliğini tür düzeyinde tespit etmek amacıyla insert ignore into journalissuearticles values(GTG);5 ve M13 primerleri kullanılarak bu izolatların Polimeraz Zincir Reaksiyonu insert ignore into journalissuearticles values(PZR); parmak izi profilleri elde edilmiştir. Çalışmada kullanılan 50 LAB izolatı için M13 primeri ile toplamda 52 lokus, insert ignore into journalissuearticles values(GTG);5 primeri ile 39 lokus üretilmiştir. Markör [M13 ve insert ignore into journalissuearticles values(GTG);5] sistemi, farklı LAB türlerine ait izolatlar arasında önemli bir değişkenlik sağlayan çok sayıda fragment üretmiştir. Kluster ve ayrım gücü analizi sonuçlarına göre silaj örneklerinin LAB profilinin moleküler karakterizasyonu için her iki primerin de [M13 ve insert ignore into journalissuearticles values(GTG);5] kullanılması gerektiği belirlenmiştir. Farklı KM oranına insert ignore into journalissuearticles values(% 20, % 30, % 40); sahip örnekler mikrobiyal çeşitlilik ve kalite açısından incelendiğinde, % 30 KM içeriği ön plana çıkmaktadır. Çalışmada, % 30 ve % 40 KM içerikli örneklerde Enterococcus sayısının artması ve buna paralel olarak silaj kalitesinin de artması silaj kalitesi üzerine Enterococcus sayısının etkili olabileceğini göstermektedir. Bu çalışmada elde edilen izolatlardan iki tanesinin silaj starteri olabilme potansiyeli bulunmaktadır. Bu veriler ışığında % 30 KM içeren karabuğday silajının yüksek LAB çeşitliliğine sahip kaliteli bir silaj ve alternatif kaba yem olacağı söylenebilir.
Keywords : Silaj, karabuğday, DNA parmak izi, Enterococcus, formik asit