Using DNA Barcoding in Fungal Taxonomy

Authors : Younes REZAEE DANESH, Semra DEMİR

Pages : 989-997

Doi:10.29133/yyutbd.751901

View : 15 | Download : 8

Publication Date : 2020-12-31

Article Type : Review Paper

Abstract :Günümüzde toplam 1.5 milyon olduğu tahmin edilen fungus türünün %10’undan daha azı tanımlanmıştır. Moleküler biyolojideki son gelişmeler ve gen sıralama teknolojileri, çeşitli canlı organizma gruplarında, özellikle funguslarda yeni türlerin keşfedilmesini ve tanımlanmasını kolaylaştırmaktadır. Fungus türlerinin tanımlanmasında morfolojik yöntemler yeterli değildir, bu nedenle, hızlı ve doğru tanımlamada DNA verilerine dayalı yeni tekniklerin kullanılması ön plana çıkarılmıştır. DNA Barkodlama, fungus ve fungus benzeri mikroorganizmaları tespit etmek için kullanılan yıllık geçmişi olan yeni bir tekniktir. Ribozomal RNA genindeki ITS-rDNA uygun bir barkod dizisi olarak kabul edilmektedir. Bu bölge sekans verilerinin etkinliği, farklı mikologlar tarafından birçok fungusta standart bir barkod olarak kullanılmasına yol açmıştır. Bununla birlikte, ITS-rDNA bölgesinin fungus cins ve türlerinin tanılanmasında birincil barkod dizisi olarak kullanıldığı görülmekte, fungus gruplarındaki türe özgü kesin tanılama ise ikincil barkodlara dayalı olarak yapılmaktadır. Fungusların pleomorfik doğası nedeniyle, DNA barkodlamasının kullanılması çok önemlidir. Bugüne kadar, DNA barkodlama projeleri ile binlerce canlı organizma türü için yüz binlerce referans barkod dizisi oluşturulmuştur. Bilim adamlarının bundan sonraki çalışmaları tanımlama sürecini hızlandırmak için DNA barkodunun yönetimi ve otomasyonu yönündedir.
Keywords : Fungi, Molecular Taxonomy, Species Concept, DNA Barcoding