Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR) and Its Current Applicatıons in Microbial Diagnosis

Authors : Emre TAŞKIN, Özlem KUTLU, Cüneyt KURU, Yeliz ESKİ

Pages : 154-160

Doi:10.34084/bshr.596146

View : 18 | Download : 8

Publication Date : 2019-12-31

Article Type : Review Paper

Abstract :Bulaşıcı hastalıklarda geleneksel tanı yöntemleri uzun zamandır başarıyla kullanılmaktadır. Geleneksel mikrobiyolojik tanı yöntemlerinin yanı sıra, gelişmiş doğruluk, maliyet etkinliği ve uygulama kolaylığı için yeni yöntemler geliştirilmektedir. Prokaryotik bağışıklık sistemi tipleri doğuştan gelen, adaptif ve programlı hücre ölümüdür. Son zamanlarda yeni bir bakteriyel tanı sistemi olarak CRISPR-Cas adlı system prokaryotik adaptif bağışıklık sisteminin bir parçasıdır ve yoğun olarak araştırılmaktadır. CRISPR-Cas sistemi, genetik tabanlı bakteriyel tanı yöntemlerinde sınıflandırılabilir ve aynı zamanda biyoteknolojik bir yöntem olarak da kullanılmaktadır. CRISPR-Cas sisteminin sınıflandırılması, Cas protein tipine ve hedef nükleik asit tipine insert ignore into journalissuearticles values(DNA veya RNA); göre yapılmaktadır. Prokaryotik hücrelerde CRISPR-Cas lokusu, tekrarlayan diziler ve spacer diziler olarak iki ana bölümden oluşur. Spacer diziler prokaryotun saldırıdan sağkalımından sonra istilacı ajanların genomundan bakteriye geçen dizilerdir. CRISPR-Cas sisteminde cas genleri prokaryotik hücrenin kendisini korumak için yabancı nükleik asidi parçalayan enzimlerdir. CRISPR-Cas sisteminin varyasyonları olarak Şu anda SHERLOCK, DETECTR ve HUDSON gibi yeni sistemler, farklı araştırma grupları tarafından geliştirilmektedir. Ayrıca CRISPR-Cas sistemi, knock-out ve knock-in sistemlerinin oluşturulmasında, transkripsiyon ve transkripsiyon sonrası seviyede gen regülasyonu gerektiren deneylerde oldukça etkilidir. CRISPR-Cas sisteminin terapötik antiviral ilaçların üretilmesinde kullanılması da planlanmaktadır. Mevcut veriler göz önüne alındığında, CRISPR-Cas, hız, düşük maliyet, yüksek doğruluk ve basit uygulama protokolü avantajları ile umut verici bir bakteriyel tanı sistemidir.
Keywords : CRISPR Cas, Mikrobiyal tanı, Mikrobiyoloji, Biyoteknoloji