- Journal of Medicine and Palliative Care
- Volume:1 Issue:3
- Otoimmün tiroid hastalıklarında CTLA-4 geninin in silico analizinin değerlendirilmesi
Otoimmün tiroid hastalıklarında CTLA-4 geninin in silico analizinin değerlendirilmesi
Authors : Duygu KIRKIK, Sevgi KALKANLI, Eylem ÇAĞILTAY, Nevin KALKANLİ
Pages : 58-63
Doi:10.47582/jompac.739257
View : 11 | Download : 5
Publication Date : 2020-09-21
Article Type : Research Paper
Abstract :Giriş: CTLA-4 insert ignore into journalissuearticles values(sitotoksik T-lenfosit ilişkili antijen 4); geni, immünoglobulin gen süper ailesinin bir üyesidir ve T hücrelerine inhibe edici bir sinyal ileten proteini kodlamaktadır. Son günlerde immün kontrol noktası olan CTLA-4 geni araştırılan genler arasındadır. Bu çalışmada amaç; CTLA-4 geninde oluşan çeşitli polimorfizmlerin, CTLA-4 geni ile benzer genlerin Otoimmün Tiroid Hastalığı insert ignore into journalissuearticles values(OTH); patogenezine katkıda bulunabileceğini in silico olarak değerlendirmektir. Gereç ve Yöntem: Çalışmamızda CTLA-4 geni ile benzer genleri bulmak için GeneMania ve STRING veri tabanları, tek nükleotid polimorfizmlerini insert ignore into journalissuearticles values(SNP’leri); bulmak için Polyphen2, Exome Variant Server ve SIFT veritabanları, mikro RNA’ları tespit etmek için; miRDB ve miRWalk veritabanları kullanıldı. Bulgular: Çalışmamızdan elde ettiğimiz verilere göre; FYN geninin OTH’nın patogenezine katkıda bulunabileceğini, CTLA-4 geniyle ilişkili insert ignore into journalissuearticles values(rs201778935, rs138279736, rs369567630 ve rs376038796); şüpheli SNP’lerin olduğunu tespit ettik. Sonuç: Çalışmamızda 31 miRNA’nın mesajcı RNA’ların protein üretmesini düzenleyici rol üstlendiğinden, terapötik açıdan önemli olduğunu düşünmekteyiz. Biyoinformatik yöntemlerle değerlendirdiğimiz bu çalışma, ilerde laboratuvar ortamında uygulanarak, birçok hastalığın patogenezinin aydınlatılmasına katkıda bulunabileceğini düşünmekteyiz.Keywords : CTLA 4, , in silico, , miRNA, , SNP, , biyoinformatik