OmpC -OmpF PORIN PROTEINS EXPRESSION OF Escherichia coli IN NUTRIENT BROTH AND THE ROLE OF EnvZ, OmpR, H-NS, AcP AND RpoS ON THIS EXPRESSION

Authors : Cihan DARCAN, Reşit ÖZKANCA

Pages : 1-10

View : 14 | Download : 5

Publication Date : 2007-12-17

Article Type : Research Paper

Abstract :OmpC ve OmpF porin proteinlerinin farklı çevresel şartlarda Escherichia coli’nin yaşamında önemli bir rol oynamasına rağmen sentezi üzerine farklı çevresel şartların etkisi ve mekanizması henüz tam olarak bilinmemektedir. Bu çalışmada zengin besiyeri olarak nutrient brot besiyerinde üretilen E. coli’nin OmpC ve OmpF porin sentez düzeyi ve bu sentezin kontrolünde EnvZ, OmpR, H-NS, AcP ve RpoS’nin rolü araştırılmıştır. E. coli’nin envZ, ompR, hns, pta ve rpoS gen bölgelerinin mutasyona uğratılmasının besiyerinde üreme açısından yabani tipe göre bir değişim göstermediği belirlenmiştir. Protein sentezinde ise üreme süresince OmpC sentezi artarken, OmpF sentezi oldukça azalmıştır. Yabani tip E. coli’ye göre özellikle rpoS mutantında OmpF, pta mutantında ise OmpC nin oldukça yüksek olduğu tespit edilmiştir. EnvZ’nin porin sentezi için oldukça önemli olduğu, OmpR’nin olmadığı durumda sentezin gerçekleşmediği belirlenmiştir. hns mutasyonunda ise OmpC ve OmpF sentezinin hafifçe arttığı belirlenmiştir. OmpC ve OmpF porin proteinlerinin farklı çevresel şartlarda Escherichia coli ’nin yaşamında önemli bir rol oynamasına rağmen sentezi üzerine farklı çevresel şartların etkisi ve mekanizması henüz tam olarak bilinmemektedir. Bu çalışmada zengin besiyeri olarak nutrient brot besiyerinde üretilen E. coli ’nin OmpC ve OmpF porin sentez düzeyi ve bu sentezin kontrolünde EnvZ, OmpR, H-NS, AcP ve RpoS ’nin rolü araştırılmıştır. E. coli ’nin envZ , ompR, hns, pta ve rpoS gen bölgelerinin mutasyona uğratılmasının besiyerinde üreme açısından yabani tipe göre bir değişim göstermediği belirlenmiştir. Protein sentezinde ise üreme süresince OmpC sentezi artarken, OmpF sentezi oldukça azalmıştır. Yabani tip E. coli ’ye göre özellikle rpoS mutantında OmpF, pta mutantında ise OmpC nin oldukça yüksek olduğu tespit edilmiştir. EnvZ’nin porin sentezi için oldukça önemli olduğu, OmpR’nin olmadığı durumda sentezin gerçekleşmediği belirlenmiştir. hns mutasyonunda ise OmpC ve OmpF sentezinin hafifçe arttığı belirlenmiştir.
Keywords : Escherichia coli, Porin, H NS, RpoS, AcP