Molecular survey of Anaplasma phagocytophilum in small ruminants from Şanlıurfa

Authors : Müzeyyen ATAŞ, Nazir Dumanlı, Kürşat ALTAY

Pages : 1-8

View : 12 | Download : 9

Publication Date : 2016-12-01

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu araştırma, Şanlıurfa yöresinde koyun ve keçilerde Anaplasma phagocytophilum’un varlığı ve yaygınlığının belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Bu amaçla, Şanlıurfa yöresinde 134 koyun ve 74 keçi olmak üzere toplam 208 hayvandan tam kan örneği alınmıştır. Bu örneklerden total genomic DNA’lar izole edilmiş, elde edilen DNA örnekleri Anaplasma phagocytophilum’un varlığı yönünden 16S SSU rRNA genine spesifik primerler kullanılarak, polimeraz zincir reaksiyonu insert ignore into journalissuearticles values(PZR);’na tabi tutulmuştur. Polimeraz zincir reaksiyonu sonucunda pozitif olduğu belirlenen örnekleri temsilen seçilen bir örneğin 16S SSU rRNA geninin DNA dizilimi belirlenmiştir. İncelenen 208 koyun ve keçiye ait kan örneğinin 9 insert ignore into journalissuearticles values(% 4.33);’unda A. phagocytophilum’un varlığını gösteren PZR amplifikasyon ürünü elde edilmiştir. A. phagocytophilum pozitiflik oranının koyunlarda % 5.97 insert ignore into journalissuearticles values(8/134);, keçilerde % 1.35 insert ignore into journalissuearticles values(1/74); olduğu saptanmıştır. Pozitif örnekleri temsilen seçilen bir örneğinin DNA dizilimi belirlenmiş, bu dizilim BLAST analiz yoluyla GenBankasındaki diğer dizilimlerle karşılaştırıldıktan sonra GenBanka KJ183079 accession numarası ile kayıt edilmiştir. Bu çalışma ile Şanlıurfa yöresindeki koyun ve keçilerde PZR ve sekans analizi ile A. phagocytohilium varlığı ilk defa ortaya konmuş ve etkene ait epidemiyolojik veriler de ilk olarak elde edilmiştir
Keywords : Anaplasma phagocytophilum, koyun, keçi, PZR, Şanlıurfa