FIRST REPORT OF Cucumis melo endornavirus WITH A NEW HOST, THE GHERKIN (Cucumis anguria Linn.), IN TURKEY

Authors : Ali KARANFİL, Savaş KORKMAZ

Pages : 63-67

Doi:10.23902/trkjnat.688646

View : 11 | Download : 8

Publication Date : 2020-04-15

Article Type : Research Paper

Abstract :Dünyada gerçekleştirilen çalışmalar sonucunda kabakgil familyasındaki bitkileri enfekte eden 50`den fazla virüs varlığı tanımlanmıştır. Virüs tespit metotlarındaki gelişmelere bağlı olarak bu sayıya her geçen gün yenileri eklenmektedir. Son yıllarda tanılanan bu virüs hastalıklarından bir tanesi de Cucumis melo endornavirus insert ignore into journalissuearticles values(CmEV);`dır. CmEV`nin enfeksiyonu dünyanın farklı ülkelerinden bildirilmiştir. Ancak, ülkemizde şimdiye kadar CmEV varlığının belirlenmesine yönelik bir çalışma gerçekleştirilmemiştir. Bu amaçla, Manisa ve İzmir illerinden virüs ve virüs-benzeri belirti gösteren 59 kabakgil bitkisinden örnekler alınmıştır. Toplanan örnekler ters transkriptaz-polimeraz zincir reaksiyonu ile test edilmiştir. Gerçekleştirilen bu testler sonucunda 47 örnekte CmEV enfeksiyonu tespit edilmiştir. Enfekteli 47 örneğin 44 tanesi kavun insert ignore into journalissuearticles values(Cucumis melo Linn.);, kalan 3 örnek ise acurdur insert ignore into journalissuearticles values(C. anguria Linn.);. Enfekteli örnekler arasından, beş tanesi insert ignore into journalissuearticles values(üç tanesi kavun, iki tanesi acur); sekans analizleri için seçilmiştir. Gerçekleştirilen sekans analizleri sonucunda CmEV izolatları kendi aralarında nükleotit düzeyinde %93-99, amino asit düzeyinde ise %94-99 benzerlikler gösterdiği belirlenmiştir. Dünya izolatları ile yapılan benzerlik analizleri sonucunda ise nükleotit düzeyinde %93-98, amino asit düzeyinde ise %91-98 benzerlikler tespit edilmiştir. Gerçekleştirilen bu çalışma ile ülkemizde ilk kez CmEV enfeksiyonu kavun ve dünya için yeni bir konukçu kaydı olan acur bitkisinde tespit edilmiştir.
Keywords : Melon, gherkin, virus, CMeV