Afyonkarahisar Yöresi Koyun Akciğer Kılkurdu Türlerinin Moleküler Karakterizasyonu

Authors : Mustafa KÖSE, Metin Erdoğan, Kürşat Kartal

Pages : 283-288

Doi:10.17094/ataunivbd.297876

View : 18 | Download : 10

Publication Date : 2017-12-20

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu araştırma, Afyonkarahisar yöresinde koyunlarda akciğer kılkurdu enfeksiyonlarının moleküler epidemiyolojisi ve akciğer kılkurdu türlerinin moleküler karakterizasyonunu ortaya koymak amacıyla yapılmıştır. Bu amaçla 5 farklı lokalitede akciğer kılkurtları ile doğal enfekte 10 sürüden akciğer kılkurdu birinci dönem larvalarını izole etmek için dışkı örnekleri toplandı. Baermann-Wetzel yöntemi ile separe edilen akciğer kılkurdu 1. dönem larvalarının spin kolon yöntemiyle ticari kit (Thermo) kullanılarak DNA’ları çıkarıldı. PCR’da akciğer kıl kurtlarının 28S rRNA bölgelerine ait primerler ( Dictyocaulus filaria : F-gctacaaaatcgcatacgaacg, R-actccttagcggttaccga; Cystocaulus ocreatus : F-cggtttgtttagcatgtccaaagtc, R-tctctgacttcgtcctgc; Muellerius capillaris : F-aaaggcccaacgctgaa, R-cctctgacttcgtcctgc) FastPCR programı ile dizayn edilerek kullanıldı. Toplam 7 izolattan elde edilen DNA PCR ürünlerinin 28S rRNA gen bölgelerinin DNA dizileme analizi yapıldı. Bir ve 2. izolatlardan elde edilen 952 bp uzunluğundaki dizilerinin %100 D. filaria , 4, 5 ve 6. izolatlardan elde edilen768 bp uzunluğundaki dizilerinin %100 C. ocreatus , 7. izolattan elde edilen 780 bp uzunluğundaki dizinin %100 M. capillaris ve 3. izolattan elde edilen 780 bp uzunluğundaki dizinin ise %99 ihtimalle M. capillaris olduğu görülmüştür. İzolat 7'nin 702. bazının heterozigot yapıda olması ve izolat 3'te 117 ve 718. bazlarında mutasyon olması bir alt tür olabileceğini düşündürmüştür. Bir sürüde rastlanılan Neostrongylus linearis larvasından DNA elde edilememiş, Sürülerde Protostrongylus rufescens larvasına rastlanmamıştır.
Keywords : 28S RNA, Akciğer kıl kurtları, Koyun, Moleküler karakterizasyon