Türkiye’de Yetiştirilen Bazı Sığır Irklarında Akirin 2 Gen Polimorfizminin PCR-RFLP Yöntemi ile Belirlenmesi

Authors : Güray COŞKUN, Bilal AKYÜZ

Pages : 123-127

View : 9 | Download : 6

Publication Date : 2016-12-20

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmada Türkiye’de yetiştirilen Simental insert ignore into journalissuearticles values(n=75);, İsviçre Esmeri insert ignore into journalissuearticles values(n=75);, Holstein insert ignore into journalissuearticles values(n=100);, Doğu Anadolu Kırmızısı insert ignore into journalissuearticles values(DAK); insert ignore into journalissuearticles values(n=40); ve Boz Irk insert ignore into journalissuearticles values(n=40); sığırlarında Akirin 2 geninde bulunan c.*188G>A tek nokta polimorfizminin insert ignore into journalissuearticles values(SNP); belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu çalışmada, c.*188G>A polimorfizmi yönünden genotipleme için polimeraz zincir reaksiyonunu takiben yapılan restriksiyon parçacık büyüklük polimorfizimi insert ignore into journalissuearticles values(PCR-RFLP); yöntemi kullanılmıştır. Akirin 2 genindeki hedef bölge, PCR ile çoğaltıldıktan sonra elde edilen PCR ürünleri FoK I endonükleaz enzimi ile kesilmiştir. Çalışmada c.*188G>A tek nokta polimorfizmi için A ve G olarak adlandırılan iki allel belirlenmiştir. En yüksek A allel frekansı Simental ırkında insert ignore into journalissuearticles values(0.27);, en yüksek G allel frekansının ise DAK ırkında insert ignore into journalissuearticles values(0.93); olduğu görülmüştür. Ayrıca, en yüksek AA ve AG frekansı Simental ırkında insert ignore into journalissuearticles values(0.07 ve 0.39);, en yüksek GG genotip frekansı ise DAK ırkında insert ignore into journalissuearticles values(0.85); belirlenmiştir. Yapılan Ki-kare analiz sonuçlarına göre incelenen beş ırkında c.*188G>A polimorfizmi yönünden Harrdy-Weinberd dengesinde insert ignore into journalissuearticles values(HWE); oldukları gözlenmiştir. Bu çalışma Türkiye’de yetiştirilen Simental, İsviçre Esmeri, Holstein, DAK ve Boz Irk sığırlarında Akirin 2 geninden bulunan c.*188G>A polimorfizmi yönünden genotiplendirilmelerinin yapıldığı ilk çalışmadır. Sonuç olarak, Türkiye’de yetiştirilen yerli ve Avrupa orijinli sığır ırklarında mermerleşme skoru gibi et kalite özelliklerinin iyileştirilmesinde Akirin 2 genindeki c.*188G>A polimorfizminin kullanılabileceği düşünülmektedir.
Keywords : Akirin 2, Genetik Belirteç, RFLP, Sığır