The genomic DNA isolation methods comparative analysis upon some Sideritis Labiateae and Serratula Asteraceae taxa

Authors : A DURAN, Fatih COŞKUN, Nur Gökçe ÇETİNER, Selami SELVİ, Necla ŞAHİN

Pages : 16-21

View : 16 | Download : 6

Publication Date : 2013-05-01

Article Type : Research Paper

Abstract :Bitkilerden genomik DNA izolasyonu için farklı izolasyon metotlar bulunmaktadır. Bitkilerin kimyasal içerikleri farklı olduğundan birbirine yakın türler için bile farklı DNA izolasyon yöntemleri gerekebilir. Bu çalışmada aromatik bitkilerden Sideritis L. cinsine ait bazı taksonlar Sideritis vulcanica Hub.-Mor., Sideritis montana L. subsp. montana, Sideritis gulendamiae H. Duman et Karavelioğulları, Sideritis congesta P.H. Davis et Hub.-Mor. ve Sideritis tmolea P.H. Davis ile Serratula L. cinsine ait bazı taksonlar Serratula bornmuelleri Azn, Serratula haussknechtii Boiss., Serratula serratuloides DC Takht. ve Serratula hakkiarica P.H. Davis, kullanılmıştır. Bu çalışmada fenolchloroform-izoamil alkol izolasyon protokolü, CTAB protokolü ve ticarî DNA izolasyon kiti Sigma, Almanya kullanılmıştır. Elde edilen gDNA örneklerinin miktarları ve saflık dereceleri jel elektroforezi ve spektrofotometre A260 / A280 ölçümleriyle belirlenmiştir. Taksonlar üzerinde yapılan çalışmanın sonuçlarına göre, 1 µl stokda ng cinsinden en çok DNA elde edilmesini sağlayan yöntemin CTAB olduğu görülmüştür
Keywords : genomik DNA izolasyonu, PCR, Sideritis, Serratula