Relationships among some endemic Hieracium L. s.str. Asteraceae taxa based on internal transcribed spacer ITS

Authors : Mutlu GÜLTEPE, Kamil COŞKUNÇELEBI, Ali Osman BELDÜZ, Uğur UZUNER

Pages : 134-141

View : 13 | Download : 5

Publication Date : 2013-05-01

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmada, 10 endemik Hieracium L. taksonuna ait 13 farklı birey, nüklear ribozomal DNA ITS bölgesinin cinsin akarabalık ilişkilerini ortaya koyabilecek yeni bilgiler sağlayıp sağlayamayacağını belirlemek amacıyla karşılaştırılmıştır. Bunun için öncelikle Kuzey Doğu Anadolu Bölgesi’nin değişik yerlerinden toplanan bireylerin sağlıklı yapraklarından genomik DNA’ları elde edilmiştir. Evrensel oligonükleotidler kullanılarak bireylere ait ITS bölgeleri polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltılmıştır. Taksonlar arasındaki filogenetik ilişkiyi ortaya çıkarmak için Neighbour-Joining NJ ve Maksimum Parsimoni MP ağaçları çizilmiştir. Baz dizinlerinin hizalanması sonucu 710 karakterden oluşan bir veri seti elde edilmiş ve örnekler arasındaki divergens değerlerinin % 0.0-2.1 arasında değiştiği bulunmuştur. ITS bölgesi taksonlar arasındaki ilişkiyi açıklama da yeterli bilgi sağlamasına rağmen analiz sonucu elde edilen NJ ve MP ağaçlarının topolojileri, cinsin seri seviyesinde geleneksel taksonomik verileriyle uyum göstermemiştir
Keywords : Asteraceae, Hieracium, ITS, nrDNA, Türkiye