Türkiye’nin güneyinde asmada Botryosphaeria geriye ölüm hastalığına neden olan fungusların filogenetik ayrımı ve patojenisiteleri

Authors : Davut Soner AKGÜL, Mümine ÖZARSLANDAN, Ali ERKILIÇ

Pages : 63-72

Doi:10.16955/bitkorb.646134

View : 10 | Download : 5

Publication Date : 2020-06-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Türkiye’deki bağlarda Botryosphaeriaceae funguslarıyla ilişkili asma gövde hastalıkları oldukça yaygın ve önemli hastalıklardandır. Dünya genelinde şimdiye kadar bu familyadan 24 türün Botryosphaeria geriye ölüm hastalığına neden olduğu rapor edilmiştir. Bu çalışmanın amacı, 2015-2018 yılları arasında Adana, Mersin, Kahramanmaraş ve Gaziantep illerindeki simptomatik asmalarda Botryosphaeriaceae izolatlarını filogenetik olarak ayırt etmek ve izolatların patojenisitelerini belirlemektir. 18 bağa ait simptomatik asma örneklerinden standart mikolojik izolasyon prosedürleri ile 22 Botryosphaeriaceae kültürü izole edilmiştir. İzolatların moleküler tanısında ITS insert ignore into journalissuearticles values(Internal Transcribed Spacer); ve TEF insert ignore into journalissuearticles values(Translation Elongation Factor 1-α); gen bölgeleri PCR ile çoğaltılmış ve bu gen bölgelerindeki nükleotid dizileri elde edilmiştir. Gen dizileri BLASTn programı kullanarak NCBI Gen Bankası’nda bulunan dizilerle karşılaştırılmış ve benzerlik oranlarına göre ön tanı yapılmıştır. MEGA 7 yazılımı kullanarak ITS ve TEF dizileri hizalanmış ve kombine bir filogenetik ağaç çizilmiştir. BLASTn ve filogenetik analizlerden sonra 7 farklı Botryosphaeriaceae türü insert ignore into journalissuearticles values(Botryosphaeria dothidea, Diplodia seriata, Lasiodiplodia theobromae, L. pseudoteobromae, Neofusicoccum parvum, N. vitifusiforme, Neoscytalidium novaehollandiae); tanılanmış ve bunların patojenisiteleri sera koşullarında, 2 ay süreyle, 1 yaşındaki asma fidanları insert ignore into journalissuearticles values(Vitis vinifera L. Cardinal); üzerinde yürütülmüştür. Lezyonların oluşumuna göre, lezyon uzunluklarını ölçerek, bu izolatların patojenisiteleri doğrulanmış ve virülenslik seviyelerinin istatistiksel ayrımı için varyans analizi uygulanmıştır. Asma fidanları üzerinde 2 aylık sürede, en virülent tür N. parvum 38.0-45.3 mm’lik lezyonlar oluştururken, virülensliği en düşük bulunan D. seriata ise 17.6-20.0 mm’lik lezyonlar meydana getirmiştir.
Keywords : Adana, Mersin, Kahramanmaraş, gövde hastalıkları, Botryosphaeriaceae, bağ