Molecular fingerprinting of Botrytis cinerea population structure from different hosts

Authors : İlknur POLAT, Görkem SÜLÜ, Aytül KİTAPCI, Emine GÜMRÜKÇÜ, Ömür BAYSAL

Pages : 121-134

Doi:10.16882/derim.2018.410051

View : 15 | Download : 7

Publication Date : 0000-00-00

Article Type : Research Paper

Abstract :Botrytis cinerea insert ignore into journalissuearticles values(teleomorph: Botryotinia fuckeliana ); örtüaltı sebze yetiştiriciliğinde kurşuni küf hastalığı etmenidir. Patojende oluşan farklılıkların bilinmesi hastalıkla mücadelenin etkinliğini arttırmaktadır. Çalışmada, Türkiye’nin Antalya ilinde yer alan 36 farklı seradan 42 adet izolat kullanılmıştır. On iki SRAP insert ignore into journalissuearticles values(sequence-related amplified polymorphism); primer kombinasyonu ve 18 ISSR insert ignore into journalissuearticles values(inter simple sequence repeat); primeri dereotu, fesleğen, marul, fasulye, hıyar, domates, biber ve patlıcandan elde edilen B. cinerea izolatlarının genetik farklılıklarının belirlenmesinde oldukça yüksek polimorfizm sağlamışlardır. ISSR ve SRAP markırlardan elde edilen sonuçlar UPGMA insert ignore into journalissuearticles values(The unweighted pair-group method with arithmetic average analysis); analizine göre izolatlar arasında 0.15-0.90 oranında değişen benzerlik elde edilmiştir. Ayrıca, cophenetic correlation değeri r=0.93 ile oldukça yüksek bulunmuştur. Cluster analizi sonuçları değerlendirildiğinde marul izolatları diğer izolatlara göre oldukça uzak kümelenmiştir. Ayrıca, tüm izolatlar için tranpozabl elementler insert ignore into journalissuearticles values( Flipper ve Boty ); araştırılmış ve sadece Flipper element tespit edilmiştir. Elde edilen genetik karakterizasyon sonuçlarına göre, B. cinerea populasyonunda oldukça yüksek seviyede genetik farklılıklar bulunmuştur. Bu durum, B. cinerea’ nın evrimselleşme potensiyeli ve gen akışlarından kaynaklanabilir. Farklı konukçulardan elde edilen bu patojenin genetik farklılıklarının belirlenmesinde kullanılan moleküler markırlar, ileride yapılacak çalışmalara da ışık tutmaktadır.
Keywords : ISSR, SRAP, ISSR, SRAP, Kurşuni küf, Genetik farklılık, Konukçu farklılığı, ISSR, SRAP, Transpoazabl elementler