TDOS/PDOS/OPDOS, reduced density gradient (RDG) and molecular docking studies of [3-(3-bromophenyl)-cis-4,5-dihydroisoxazole-4,5-diyl]bis(methylene) diacetate

Authors : Yeşim Saniye KARA, Aslı EŞME, Seda SAGDİNC

Pages : 100-110

Doi:10.25092/baunfbed.870307

View : 13 | Download : 12

Publication Date : 2022-01-05

Article Type : Research Paper

Abstract :Geniş biyolojik aktivite yelpazesi nedeniyle, 4,5-dihidroisoksazol bileşikleri, bir oksijen atomu ve bir nitrojen atomunu bitişik pozisyonda ihtiva eden beş üyeli heterosikliklerin önemli bir ailesini oluşturur. Bu nedenle 4,5-dihidroizoksazol türevi olan [3- (3-bromofenil) -cis-4,5-dihidroisoksazol-4,5-yl] bis (metilen) diasetat [BDBD] bileşiği bu çalışmada incelenmiştir. [BDBD] bileşiğinin fonksiyonel gruplarının kısmi durum yoğunluğu (PDOS), örtüşen nüfus yoğunluğu (OPDOS) ve toplam durum yoğunluğu (TDOS) DFT / B3LYP / 6-311G (d,p) yöntemi kullanılarak teorik olarak değerlendirildi. Azaltılmış yoğunluk gradyanı (RDG), molekülün zayıf etkileşimi, güçlü çekiciliği ve güçlü itme etkileşimlerini incelemek için verildi. PASS (Biyolojik Aktivite Spektrumunu Tahmin etme) analizi aktif olma olasılık verisi 0.273 ile incelenen molekül için kanserojen aktivitesini önerir. [BDBD] bileşiğinin seçilmiş bazı HIV-1 proteaz (1HSG), GyrB ATPase (3U2D) ve VEGFR-2 kinaz enzimi (4AG8) proteinlerine karşı antibakteriyel ve anti-inflamatuar aktiviteleri moleküler yerleştirme yöntemiyle araştırıldı. 1HSG, 3U2D, and 4AG8 hedef proteinleri ile [BDBD] ligandı bağlanma enerjileri sırasıyla -6.11, -4.54, and -4.80 kcal/mol olarak hesaplandı. Sonuçlar literatürle karşılaştırılarak yorumlanmıştır.
Keywords : DTF, 4, 5 dihidroisoksazol, moleküler orbital durum yoğunluğu, azaltılmış yoğunluk gradyanı RDG, moleküler yerleştirme