Çanakkale ilinde Karnabahar mozaik virüsü (Cauliflower mosaic virus CaMV) izolatlarının tanılanması ve karakterizasyonu

Authors : Hasan Tuna TUZLALI, Savaş KORKMAZ

Pages : 1-7

View : 13 | Download : 5

Publication Date : 2014-06-01

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmada Çanakkale ili ve ilçelerinde 2010-2011 üretim yılları içinde bir sörvey çalışması yürütülerek Karnabahar mozaik virüsü insert ignore into journalissuearticles values( Cauliflower mosaic virus, CaMV);’ne benzer semptom gösteren karnabahar ve lahana bitkilerinden 84 örnek toplanmıştır. Toplanan örnekler CaMV’nin varlığını belirlemek amacıyla DAS-ELISA yöntemiyle test edilmiştir. DAS-ELISA testi sonucunda 84 örnekten 63’ü CaMV ile infekteli bulunmuştur. İnfekteli bulunan örnekler içerisinden seçilen 6 izolatın moleküler özelliklerini belirlemek amacıyla kılıf protein insert ignore into journalissuearticles values(CP); genleri klonlanarak nükleik asit dizilimleri belirlenmiştir. Klonlama ve sekans analizi yapılan CaMV izolatlarına özgü nükleotid dizilimleri gen bankasında bulunan ve dünyanın farklı üretim bölgelerinden CaMV izolatlarının kılıf protein genleriyle karşılaştırılmıştır. Bu karşılaştırmalar sonucunda Çanakkale izolatlarının CP nükleotid dizilimlerinin kendi içinde % 93-100, dünya izolatları ile % 92-97 oranında bir benzerliğe sahip olduğu bulunmuştur. Yapılan filogenetik analizler sonucunda Çanakkale izolatlarının dünyanın farklı bölgelerindeki izolatlarla farklı düzeylerde ilişki gösterdiği saptanmıştır.
Keywords : Çanakkale, Karnabahar mozaik virüsü, DAS ELISA, klonlama, sekanslama