Detection of Spiroplasma citri from citrus trees in Turkey by molecular techniques

Authors : Behçet Kemal ÇAĞLAR, Gül SATAR, Saadettin BALOĞLU, Mounira İnas DRAİS, Khaled DJELOUAH

Pages : 37-42

Doi:10.29136/mediterranean.657937

View : 18 | Download : 7

Publication Date : 2020-04-01

Article Type : Research Paper

Abstract :Spiroplasma citri, kurak ve yarı kurak iklimde turunçgiller üzerindeki turunçgil palamutlaşma hastalığı insert ignore into journalissuearticles values(Citrus Stubborn Disease insert ignore into journalissuearticles values(CSD););’na neden olan bir etmendir. Bu etmenin turunçgil bahçeleri ve fidanlıklarda bulunan genç fidanlardaki enfeksiyonunun erken aşamada tespiti ve karakterizasyonu, hastalığın Spiroplasma citri’den ari bölgelere yayılmasını önlemek için büyük önem taşımaktadır. Bu çalışma, Türkiye`deki farklı Spiroplasma citri suşlarının muhtemel varlığını araştırmak amacıyla yapılmıştır. Eylül ayında Adana ilinin Kozan ilçesinde farklı köylerde bulunan turunçgil bahçelerindeki Stubborn hastalığına benzer çoğunlukla boğum arası kısalma, yapraklarda kaşıklanma ve leke, sezon dışı çiçeklenme ve tipik küçük palamut tipi meyve simptomları gösteren ağaçlardan yaprak ve meyve örneği toplanmıştır. Türk izolatlarının saptanması ve karakterizasyonu için, polimeraz zincir reaksiyonu insert ignore into journalissuearticles values(PZR); Spiralin-f/r, P89-r/f ve P58-6f/4r primer çiftleri kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Spiralin-f/r primerlerinde pozitif sonuç saptanmamıştır. Buna karşın, testlenen tüm örnekler P89-r/f ve P58-6f/4r primer çiftlerine pozitif sonuç vermiştir. P89-r/f primer çiftinden elde edilen PZR ürünleri sekanslanmış ve filogenetik ağaç oluşturulmuştur. Elde edilen filogenetik ağaç, önemli bir turunçgil üretim merkezi olan Adana ilindeki turunçgil ağaçlarında saptanan Spiroplasma citri izolatlarının, Fas, Mısır ve Amerika Birleşik Devletleri insert ignore into journalissuearticles values(ABD);`nden izole olanlardan daha ziyade Meksika, İspanyol, Cezayir ve İtalyan izolatlarıyla yakından ilişkili olduğunu kanıtlamıştır.
Keywords : Turunçgil, Filogenetik ilişki, Gen dizileme, Stubborn