Genetic and Clinical Evaluation of Retinitis Pigmentosa

Authors : Özgür EROĞUL, Muhsin ELMAS, Mustafa DOĞAN, Hamidu Hamisi GOBEKA, Ayça Nur DEMİR, Leyla ERYİĞİT EROĞUL

Pages : 749-756

Doi:10.16899/jcm.1131536

View : 20 | Download : 10

Publication Date : 2022-09-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Bu çalışmanın amacı, coğrafi bölgemizdeki retinitis pigmentosa (RP) hastalığının en sık altta yatan genetik ve klinik etiyolojilerini değerlendirmektir. Gereç ve Yöntem: Arşivimizde 2015-2021 yılları arasında kliniğimize başvuran yaklaşık 3000 hasta bulunmaktadır. Kesin genetik tanısı olan yaklaşık 700 hastanın dosyaları geriye dönük olarak tarandı. Bu hastaların 22'sine kesin genetik tanı konuldu. Araştırmamız sırasında hastaların doğum öncesi, doğum ve doğum sonrası öyküleri, ameliyat ve nöbet öyküsü ve aile öyküsü gibi bazı klinik parametreleri topladık. Aile öyküsünde, en az 3 kuşak analizi ile ayrıntılı bir soyağacı yaptık, ebeveyn akrabalığını sorguladık, ailelerde benzer üyeler aradık ve bozukluklarının kalıtım kalıplarını belirledik. 3 kuşak pedigri çizdik ve hastalardan periferik venöz kan örnekleri topladık ve bunları gen panelleri veya WES için ticari bir laboratuvara gönderdik. Tüm hastaların kesin genetik tanısını aldıktan sonra sorguladığımız diğer parametreleri içeren bir tablo oluşturduk. Bulgular: 1 ve 2 numaralı hastalarda WES analizimiz sonucunda homozigot c.1331_1332 dupAG/p. Hasta #2'nin POC1B geninde Thr445ArgfsTer10 Sınıf 2 varyantı tespit edildi.3 ve 4 numaralı hastaların RP panel 1 raporlarında ABCA4 (NM_000350) geninin 15. ekzonunda c.2254dupA (p.Ser752Lysfs*14) genomik değişikliği tespit edildi. Hasta 5, EYS c.4964T>C heterozigot. Hasta 6,. SEMA4A C.1168A>G (heterozigot). Hasta 7, SEMA4A C.1168A>G (heterozigot), RP1 c.5402C>T (heterozigot), CGNB1 c.1382C>T (heterozigot).Hasta #8, . SEMA4A genindeki p.Thr390Ala'nın (c.1168A>G) heterozigot değişimi mevcut.WES analizimiz sonucunda hasta #9'un RPGRIP1 geninde homozigot c.2021C>A/p.Pro674His Sınıf 2 varyantı tespit edildi. 10 numaralı hastanın NR2E3 geninde heterozigot c.119-2A>C Sınıf 1 mutasyonu tespit edildi. 11 numaralı hastada MFRP geninde homozigot c.271C>T/p.Gln91* Sınıf 1 mutasyonu tespit edildi.Hasta #12, 7-8 yaşlarında teşhis edildi. Ekzom dizileme sonuçlarına baktığımızda 13 numaralı hastanın CNGB1 geni c.413-1G>bir homozigot mutasyon tespit edildi.Hasta #14'ün ABCA4 geninde saptanan heterozigot p.Ser361Tyr (c.1082C>A) değişikliği saptandı.15 numaralı hastanın RHO geninde saptanan heterozigot p.Glu150Lys (c.448G>A) değişikliği, ClinVar veri tabanına ve in silico analizine göre patojenik olarak puanlandı. 16 numaralı hastada Ön tanı Bardet-Biedle Sendromu olarak konuldu.17 ve 18 numaralı hastaların RPE65 geninde p.Gly244Asp değişikliği saptandı. Hasta #19 ve hasta #20'nin otomatik DNA dizilimi, NR2E3 genlerinin kodlama dizisinde bir homozigot dizi varyasyonu, bir homozigot CGG>CAG nükleotid ikamesi ve Arg311Gln'nin bir amino asit değişimi ile sonuçlanır. 21 numaralı hastada (babalar) aynı gen bölgesinde heterozigot mutasyon tespit edildi. NR2E3'teki varyasyon, tam bir genotip olduğundan ve birçok yayınlanmış ailede RP ile güçlü bir şekilde ilişkili olduğundan, bu hastaların göz durumunun en olası nedenidir.22 numaralı hastanın BBS1 geninin bir alelinde (chr11:66.278.121-66.291.364 (13.2kb)/ISCN: seq [GRCH37]11q13.2(66.278). 121-66.291.364)x1) genetik sonuçlarda. Diğer alel heterozigot nokta mutasyonuna sahiptir (c.1424dupT p.Ser476fs-rs886039798). Sonuç: Çalışmamızda da belirlendiği üzere hastalık birçok farklı genetik etiyoloji ile karşımıza çıkabilmektedir. Bu bağlamda, genetik teste tabi tutulan hastalar hem SNP (tek nükleotid polimorfizmi) hem de CNV (kopya sayısı varyasyonu) açısından dikkatle incelenmelidir.Ayrıca genetik testler yapılmadan önce izole bir RP veya eşlik eden bir RP olup olmadığı iyi belirlenmelidir. Bu açıdan hastalar ayrıntılı bir anamnez ve fizik muayene yapılarak ve en az 3 kuşağı içeren soyağacı çizilerek değerlendirilmelidir. Bu nedenle retinitis pigmentosa anomalilerinin değerlendirilmesinde eşlik eden anormalliklerin de incelenmesi gerektiği sonucuna varıldı.
Keywords : Retinitis pigmentosa, genetik mutasyonlar, genetik etiyolojiler, gen tedavileri