Computational Investigation of 5.5``,7``-trihydroxy-3,7-dimethoxy-4`-4```-O-biflavone from Flavonoids Using DFT Calculations and Molecular Docking

Authors : Mehmet BAĞLAN, Ümit YILDIKO, Kenan GÖREN

Pages : 283-298

Doi:10.37094/adyujsci.1121018

View : 14 | Download : 5

Publication Date : 2022-12-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmada, 5,5\`\`,7\`\`-trihidroksi-3,7-dimetoksi-4\`-4\`\`\`-O-biflavon insert ignore into journalissuearticles values(TDOB); molekülünün yapısal karakterizasyonu yapıldı. Bu molekülün yapısal karakterizasyonu için, molekülün kararlı faz geometrisine dayalı olarak, tüm hesaplamalar sırasıyla CAM-B3LYP ve PBEPBE metotlarını SDD ve LanL2DZ temel seti kullanılarak yapıldı. Çalışmamızda TDOB molekülünün HOMO-LUMO enerji boşlukları, yörüngeler arası ve yörüngeler arası bağ etkileşimleri, elektrostatik yüzey haritalama işlemleri gibi birçok hesaplamalarda yapılmıştır. Çalışmamızın devamında moleküler doking kullanılarak ligandın protein üzerindeki spesifik bağlanma yeri ve mekanizması araştırıldı. Doking çalışmasında, TDOB- aldoz reduktaz insert ignore into journalissuearticles values(PDB: 4ICC); ve TDOB- aldoz reduktaz insert ignore into journalissuearticles values(PDB: 4IGS); ile afinite skorları sırasıyla -8.559 kcal/mol ve -5.461 kcal/mol olarak bulundu. TDOB- aldoz reduktaz insert ignore into journalissuearticles values(PDB: 4ICC); reseptör bağlanma skoru daha büyük olduğu tespit edildi. Moleküler doking çalışmasının devamında TDOB\`nin inhibitör özellikleri, her ikisi de etkili inhibisyon gösteren insert ignore into journalissuearticles values(PDB: 4ICC); ve insert ignore into journalissuearticles values(PDB: 4IGS); enzimlerine karşı araştırıldı ve TDOB molekülünün, insert ignore into journalissuearticles values(PDB: 4ICC); ve insert ignore into journalissuearticles values(PDB: 4IGS); aldoz reduktaz enzimlerini etkili bir şekilde inhibe ettiği görüldü.
Keywords : Flavonoids, TDOB, HOMO LUMO, Molecular docking