SSR Markörlerinin Mercimek Genom Haritalamasında Kullanılması

Authors : Abdullah KAHRAMAN, Ümran Akgün YILDIRIM, Melike BAKIR

Pages : 14-22

View : 18 | Download : 6

Publication Date : 2019-06-01

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmada, mercimek Lens culinaris Medik. bitkisinin genomuna ait bağlantı linkaj haritasına SSR Simple Sequence Repeats markörlerinin katılımı amaçlanmıştır. Genom haritası oluşturulmasında WA8649041 ve Precoz ebeveynlerin çaprazlanmasıyla elde edilen 93 adet rekombinant saf hat Rekombinant Inbred Lines, RILs populasyonu kullanılmıştır. Çalışmada 175 SSR primeri kullanılmış, bu primerlerden 25 adedi polimorfik, 109 adedi monomorfik, 41 adedi çalışmamıştır. Polimorfik olduğu tespit edilen SSR markörlerinden, 13 adedi haritalanmış, haritalanan markörler, genetik bağlantı haritasında belirli bir kromozom veya grupta toplanmayıp farklı bağlantı gruplarına dağılmıştır. Hali hazırda mevcut 123 markörden oluşan genom haritasına 57 AFLP, 48 RAPD, 16 ISSR ve 2 morfolojik markör , bu çalışmayla 13 SSR markör ilave edilerek genom haritasındaki toplam markör sayısı 136 olmuştur. Genom haritası 11 bağlantı linkaj grubundan oluşmuş, toplam harita uzunluğu 1311.2 cM ve iki markör arası ortalama uzunluk 9.64 cM olarak belirlenmiştir
Keywords : Mercimek, Moleküler Markör, SSR Basit Dizi Tekrarları, RIL Rekombinant