DOĞU AKDENİZ SEDİMANLARINDAN İZOLE EDİLEN BAKTERİLERİN FİLOGENETİK ÇEŞİTLİLİĞİ VE ANTİBİYOTİK DİRENÇLİLİĞİ

Authors : İlknur TUNÇER, Nihayet BİZSEL

Pages : 151-169

Doi:10.18036/estubtdc.598740

View : 12 | Download : 14

Publication Date : 2019-07-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Normal 0 21 false false false TR X-NONE X-NONE /* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:"Normal Tablo"; mso-tstyle-rowband-size:0; mso-tstyle-colband-size:0; mso-style-noshow:yes; mso-style-priority:99; mso-style-parent:""; mso-padding-alt:0cm 5.4pt 0cm 5.4pt; mso-para-margin-top:0cm; mso-para-margin-right:0cm; mso-para-margin-bottom:8.0pt; mso-para-margin-left:0cm; line-height:107%; mso-pagination:widow-orphan; font-size:11.0pt; font-family:"Calibri",sans-serif; mso-ascii-font-family:Calibri; mso-ascii-theme-font:minor-latin; mso-hansi-font-family:Calibri; mso-hansi-theme-font:minor-latin; mso-fareast-language:EN-US;} Doğu Akdeniz'in sığ ve derin bölgelerindeki sedimanlardan izole edilen bakterilerin filogenetik çeşitliliği ve antibiyotik duyarlılığı çalışılmıştır. Dünyadaki en oligotrofik ortamlardan biri olan çalışma alanından izole edilen 153 suşun Firmicutes ve Gammaproteobacteria taksonlarına ait oldukları bulunmuştur. 16S rRNA gen dizisi analizi ile belirlendiği üzere, her sediman örneğinde Bacillus en sık görülen cins olmuştur. Bu çalışmada 10 farklı bakteri ailesinden çok çeşitli türler elde edilmiş, özellikle toplam izolatların yüzde 12’sini yeni türlerin oluşturduğu görülmüştür. En yüksek antibiyotik direncinin derin havzalara kıyasla kıyı sedimanlarda olduğu gösterilmiştir. Çevresel parametrelerin bakteri toplulukları üzerinde etkisinin olduğu belirtilmekle birlikte Doğu Akdeniz'in derin havzalarına kıyasla özellikle Kuzey Ege Denizi'ndeki daha sığ bölgeler için yüksek taksonlarda daha fazla filogenetik çeşitliliğin olduğu ortaya konmuştur.
Keywords : Bakteri filogenetiği, 16S rRNA genleri, Antibiyotik duyarlılık, Akdeniz