Sağlıklı sığırların nazal boşluk flora bakterilerinin moleküler identifikasyonu

Authors : Zeynep ESKİN, Süheyla TÜRKYILMAZ

Pages : 33-38

View : 29 | Download : 14

Publication Date : 2014-12-15

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmada, klinik olarak sağlıklı sığırların nazal florasını oluşturan aerobik bakterilerin belirlenebilmesi için, alınan nazal sıvap örneklerinden izole edilen etkenlerin, 16S rRNA dizi analizi ile moleküler identifikasyonlarının yapılması amaçlandı. Çalışmada 15 çiftlikteki 56 sığırdan alınan nazal sıvap örnekleri kullanıldı. Nazal sıvaplardan konvansiyonel yöntemler kullanılarak bakteri izolasyonu gerçekleştirilip, etkenlerin makroskobik ve mikroskobik morfolojileri incelendikten sonra, identifikasyonları üniversal primerler kullanarak 16S rRNA geni polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltıldı. İzolasyonları yapılan 192 mikroorganizmanın sekans analizi ile 143 (%74,5)’ünün Gram pozitif ve 49 (%25,5)’unun Gram negatif mikroorganizma olduğu tespit edildi. Koagulaz negatif stafilokoklar (%36,5), Bacillus sp. (%15,6), S. aureus (%11,0), M. haemolytica (%6,3), Enterobacteriaceae sp. (%6,8), P. multocida (%5,2), M. luteus (%4,2), Streptococcus sp. (%2,6), Acinetobacter sp. (%2,6), Pseudomonas sp. (%2,1) ve Corynebacterium sp. (%1,0) en çok identifiye edilen türler olarak belirlendi. Bu çalışmada konvansiyonel mikrobiyolojik yöntemler ve moleküler identifikasyon yöntemlerinin büyük oranda birbirleri ile uyumlu oldukları görüldü. Bundan sonra yapılacak olan çalışmalarda, floradan izole edilen mikroorganizmaların virulens ve antibiyotik direnç genlerinin incelemesi yapılabilir.
Keywords : Süheyla TÜRKYILMAZ, Zeynep ESKİN, Bakteri, Nazal flora, Moleküler İdentifikasyon, 16S rRNA, Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi, 2014