Expression of miR-143, miR-145, miR-192, Tumor Suppressor miRNAs using qPCR in Colon Cancer stage II

Authors : Çiğdem GÜNGÖRMEZ, Hatice Gumushan AKTAS, Ersin BORAZAN

Pages : 40-45

View : 12 | Download : 9

Publication Date : 2017-12-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Bu çalışmada Stage II kolorektal kanserli hastalardan alınmış tümörlü ve normal kolon/rektum dokularında Tümör süpressör mikroRNA (miRNA) olan miR-143, miR-145 ve miR-192’in ekspresyon seviyelerinin qRT-PCR ile tespit edilmesi ve elde edilen verilerin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Materyal ve Metod: Bu çalışma Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Araştırma ve Uygulama Hastanesi Genel Cerrahi Anabilim Dalı’nda laboratuar ve patalojik bulgular ile klinik değerlendirme sonucunda kolorektal kanser tanısı konmuş 9 hastanın tümörlü ve normal (kontrol-temiz cerrahi sınırları) kolon/rektum dokuları ile gerçekleştirilmiştir. qRTPCR uygulaması için miRNeasy mini kit ile izole edilen miRNA’lar kullanıldı. İzole edilen miRNA’lar miScript RT-PCR ticari kit ile cDNA’ya dönüştürüldü. Doku örneklerindeki miRNA ekspresyon seviyeleri RT- SYBR Green qPCR kiti kullanılarak Rotor Gene Q sistemi ile belirlendi. Bulgular: Kolorektal kanser teşhisi konulmuş 9 hastanın ortalama miRNA-143 ekspresyon seviyesi normal doku ve tümörlü doku karşılaştırıldığında 0.096 kat azaldığı, miR-145’in ise 1.52 kat azaldığı tespit edilmiştir. Bu artış istatiksel olarak anlamlı bulunmuştur (p˂0,05). miR-192 tümör baskılayıcı miRNA olmasına rağmen ekpresyon miktarının normal ve tümör dokusu fold chance değerleri karşılaştırıldığında 3.25 kat arttığı tespit edilip istatiksel olarak anlamlı bulunmamıştır (p˃0,05). Sonuç: Çalışmamızdan elde ettiğimiz bulgulara göre kolorektal kanserde tümör süpressör miRNA olan miR-143 ve miR-145’in hastaların tümörlü kolon dokularında ekspresyon seviyeleri azalmıştır. miRNA'lar, kanser gelişimi ve ilerlemesindeki moleküler yollarda önemli etkiler etmektedir. miRNA’lar hücresel birçok işleve ek olarak, kanser tanı ve tedavisinde biyobelirteç olarak kullanılabileceği düşünülmektedir.
Keywords : miRNA, Tümör baskılayıcı miRNA, Biyobelirteç, Kolon kanseri