Salda Gölü Prokaryotik Çeşitliliğinin Yeni Nesil Dizileme Yöntemiyle Belirlenmesi

Authors : Nilgün POYRAZ, Mehmet Burçin MUTLU

Pages : 99-106

View : 14 | Download : 8

Publication Date : 2017-09-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Çalışmada Salda Gölü’nden örnekleme yapılmış ve örnek için pH ve tuzluluk değerleri belirlenmiştir. Sonrasında örnekler fltreden geçirilerek, bu fltrelerden DNA ekstraksiyonu işlemi yapılmıştır. Elde edilen DNA Illumina MiSeq dizileme sistemiyle dizilenmiş ve veriler QIIME Programı ile analiz edilmiştir. Analiz sonrası elde edilen veriler değerlendirildiğinde en baskın bulunan Bacteria flumlarının Proteobacteria ve Actinobacteria olduğu belirlenmiştir. Sınıf düzeyinde ise Gammaproteobacteria, Acidimicrobia ve Actinobacteria baskındır. Ordo düzeyinde ise Enterobacteriales, Acidimicrobiales, Actinobacteriales baskındır. Archaea domaini değerlendirildiğinde ise Euryarchaeota flumunun baskın olduğu belirlenmiştir. Sınıf düzeyinde Halobacteria üyeleri baskındır. Halobacteria sınıfının Halobacterialaes ordosu Halobacteriaceae familyasının Haloarcula , Halobacterium , Halonotius , Halorhabdus , Halorubrum ve Haloplanus cinsi üyeleri de baskın olarak bulunmaktadır
Keywords : Alkaliflik, prokaryotik çeşitlilik, Salda Gölü, yeni nesil dizileme