Konya İlinde Yetiştirilen Patates Yumrularında Lastik Çürüklük Hastalık Etmeni Geotrichum candidum’un İzolasyonu, Morfolojik ve Moleküler Karakterizasyonu

Authors : Soner SOYLU, Merve KARA, Osman TOKETTİ, Emine Mine SOYLU, Aysun UYSAL, Şener KURT

Pages : 353-361

Doi:10.18016/ksutarimdoga.vi.714056

View : 13 | Download : 9

Publication Date : 2021-04-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Patates (Solanum tuberosum L.), Türkiye’de en fazla tüketilen sebzelerin başında gelmektedir. Konya ilinin Çumra ilçesinde 2019 yılının Temmuz ayında patates yetiştirilen alanlarda gerçekleştirilen sörveyler sırasında ekşi koku yayan patates yumrularında beyaz miselyum ile kaplanmış suya batırılmış yumuşak lastik çürüklük lezyonları şeklinde yeni hastalık belirtileri gözlenmiştir. Yüzey dezenfeksiyonu yapılan enfekteli yumrulardan alınan dokular Patates Dekstroz Agar (PDA) besiyeri üzerine yerleştirilmiş ve 25°C’de inkübasyona bırakılmıştır. Enfekteli dokulardan hızlı büyüyen beyaz, düz ve süetimsi-tozlu görünümlü pigmentsiz fungal koloniler gelişmiştir. Gelişen kolonilerin miselyumları dichotomous olarak dallanmış, şeffaf ve bölmeli yapıda olup, hiflerden oldukça farklı boyutlarda şeffaf, tek hücreli ve silindirik yapıda havai artrokonidilerin geliştiği gözlenmiştir. Fungal etmenin kültürel ve morfolojik özellikleri Geotrichum candidum ile tutarlıdır. Yapay inokulasyon yapılan patates yumruları üzerinde doğal enfekteli patates yumrularında görülen belirtilerin benzeri gözlenmiş olup fungal etmen bu dokulardan yeniden izole edilmiştir. İzole edilen fungal etmenin morfolojik tanısı, Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) cihazı kullanarak protein profili ve Internal Transcribed Spacer (ITS) gen bölgesi (ITS1-5.8S rDNA-ITS4) çoğaltılıp dizilenmesi ile moleküler olarak da teyit edilmiştir. Gen bankasına kaydedilen temsili izolatın sekans sonucu G. candidum izolatı ile %99 oranında benzerlik göstermiştir. G. candidum’un sebep olduğu patates lastik çürüklük hastalığının varlığı Türkiye’de önceden bildirilmemiştir. Türkiye’de yetiştirilen patates yumrularında lastik çürüklüğü hastalığı etmeni G. candidum’un morfolojik ve moleküler karakterizasyonu ilk kez bu çalışma ile ortaya konulmuştur.
Keywords : Patates, Lastik çürüklük, Geotrichum candidum, MALDI TOF, ITS