High-Throughput Genomic Simple Sequence Repeat (SSR) Marker Development and Construction of a High Resolution Physical Map in Button Mushroom (Agaricus bisporus) Genome

Authors : Ali Tevfik UNCU, Ayse Ozgur UNCU

Pages : 28-35

Doi:10.30708/mantar.391682

View : 14 | Download : 5

Publication Date : 2018-04-25

Article Type : Research Paper

Abstract :Kültür mantarı [Agaricus bisporus insert ignore into journalissuearticles values(J.E. Lange); Imbach], bir model organizma olmasının yanı sıra dünya genelinde yetiştirilen bir yenilebilir mantar türüdür. Bilimsel ve ekonomik önemine rağmen A. bisporus genomuna özel moleküler markör geliştirme çalışmaları ancak yakın zamanda gerçekleştirilmeye başlanmış olup, oldukça kısıtlı sayıdadır. Bu çalışma kapsamında A. bisporus genomuna özel 3943 adet yeni basit dizi tekrarı insert ignore into journalissuearticles values(SSR); markörü geliştirilmiştir. Geliştirilen markörler A. bisporus kromozomlarına dengeli şekilde dağılmakta olup, genomun sekans-spesifik markörler ile doyurulmasını sağlamaktadır. Çalışma kapsamında tanıtılmakta olan yüksek sayıdaki A. bisporus’a özel yeni DNA markörü, bu türde gerçekleştirilecek moleküler genetik çalışmalar için kıymetli bir kaynak teşkil edecektir.
Keywords : Moleküler genetik, Biyoinformatik, Sekans spesifik markörler, DNA markörleri