Aspergillus Türlerinin Moleküler Tanımlanması için Hızlı, Doğru ve Düşük Maliyetli Yenilikçi Yaklaşım

Authors : Yüksel GEZGİN, Sibel ARSLAN, Zeycan NURÇE

Pages : 113-121

Doi:10.30708/mantar.904921

View : 11 | Download : 4

Publication Date : 2021-10-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Aspergillus türlerinin bazıları ekonomik açıdan önemli tarımsal ürünleri kontamine ederek en yaygın gıda bozulmalarına sebep olan mantarlardır. Bu türler ayrıca insan sağlığını tehdit eden karsinojenik, teratojenik ve mutajenik etkilere sahip mikotoksinleri üretmektedirler. Tüm bu nedenlerden dolayı Aspergillus türlerinin kesin ve doğru tanımlamaları büyük önem taşımaktadır. Bu çalışmada Misel Doku-Polimeraz Zincir Reaksiyon insert ignore into journalissuearticles values(MD-PZR); temelli moleküler teknik geliştirilerek Polimeraz Zincir Reaksiyonunda kalıp olarak kullanılan genomik DNA basamağı ortadan kaldırılmıştır. Bu misel doku-PZR temelli moleküler tekniğinin pahalı ve özel donanım gerektirmemesi, proteinaz K, RNAaz veya başka enzimler gibi pahalı kimyasallara ihtiyaç duyulmaması, genomik DNA izolasyon işlemleri sırasında fenol/kloroform gibi toksik kimyasalların kullanılmaması gibi avantajları bulunmaktadır. Ayrıca sıvı kültür ile misel üretimine dayalı klasik DNA ekstraksiyon protokolleri zaman alıcıdır. Bu çalışmada Aspergillus izolatlarının moleküler tanımlanması için misel doku örnekleri kullanılarak iki farklı gen bölgesi insert ignore into journalissuearticles values(β-tubulin: benA, Calmodulin: CaM); çoğaltılmıştır. Daha sonra tüm PZR ürünleri saflaştırılıp ve dizi analizine gönderilmiştir. Sekans analiz sonuçları biyoinformatik araçlar kullanılarak incelenmiş ve izolatlar tür düzeyinde Aspergillus tubingensis insert ignore into journalissuearticles values(Divane Asper); R. Mosseray olarak tanımlanmışlardır.
Keywords : Aspergillus, Kalmodulin Geni, Beta Tubulin Geni, Polimeraz Zincir Reaksiyonu